Amilopektin ialah satu polimer kanji yang bercabang-cabang. Terdapat ikatan glikosida α-1:4 dan ikatan glikosida α-1:6 yang terdapat pada titik cabang. Satu molekul amilopektin mempunyai kira-kira 3000 molekul glukosa.

Struktur kimia amilopektin

Amilopektin membentuk larutan berkoloid atau bermisel yang tidak larut dalam air. Ia menghasilkan warna merah ungu dengan iodin.