Strategi mereka ialah dengan tindakan kekerasan dengan menyasarkan kepentingan Barat yang terdapat di rantau ini.
Jamaah Islamiyah disyakkidisyaki terlibat di dalam [[Pengeboman Bali]] pada 12 Oktober, 2002 yang mengorbankan 202 orang di beberapa buah kelab malam di sana. Selepas serangan tersebut, Jabatan Negara Amerika Syarikat telah mengklasifikasikan Jamaah Islamiyah sebagai sebuah Organisasi Pengganas Antarabangsa atau ''Foreign Terrorist Organization''. Jemaah ini juga dituduh melancarkan beberapa serangan di Asia Tenggara seperti letupan bom di [[Zamboanga]] dan [[Metro Manila]], di [[Filipina]] dan yang paling baru letupan di kedutaan Indonesia pada [[2004]].
