Statistik untuk Islam di Ecuador menganggarkan jumlah penduduk Islam lebih kurang 275.[perlu rujukan] Peneroka-peneroka Islam pertama di Ecuador adalah asasnya orang Arab yang menghijrah dari Lubnan, Palestin, Syria, dan Mesir berikutnya dua Perang Dunia dan kebinasaan Empayar Uthmaniyyah. Perkampungan mereka bertumpuan di Quito dan di Guayaquil dengan komuniti-komuniti lebih kecil di provinsi Manabí, Los Ríos, dan Esmeraldas. Orang Arab Kristian dan Islam mencipta sebuah pertubuhan etnik bukan agama digelar Lecla pada 1940an dan Kelab Arab pada 1980an. Pada pertengagan 1990an orang asli Ecuador bermula memeluk Islam, dan bersama dengan komuniti Arab, mereka menyewa sebuah pangsapuri digunakan untuk solat Jumaat. Kemudian Kedutaan Mesir memberikan sebuah pangsapuri peribadi untuk tujuan yang sama. Centro Islámico del Ecuador, diasaskan pada Oktober 15, 1994, adalah pertubuhan agama Islam pertama diakui oleh kerajaan. Pemimpin kininya adalah Juan 'Yahya' Suquillo, seorang mualaf dan bekas pegawai ketenteraan. Aktiviti-aktiviti agama, dan juga aktiviti-aktiviti sosial, budaya dan pendidikan dijalankan menurut dengan Islam Sunah Waljamaah dan pusat ini tidak menerima sokongan kewangan dari mana-mana negara asing. Pusat Islam ini juga menterjemahkan dan menerbitkan sastera dalam bahasa Sepanyol di berbagai topik Islam. Centro Islámico del Ecuador mengirim wakil-wakil secara tahunan di perhimpunan Pemimpin-Pemimpin Islam Latin yang biasanya mengambil tempat di Argentina.


Pada 2004 Centro Islámico Al Hijra telah diasaskan di Guayaquil - bandar terbesar dan pusat ekonomi Ecuador - dan diakui oleh kerajaan sebagai sebuah pertubuhan agama. Pemimpin kininya adalah Juan 'Abdullah' Saud yang adalah seorang mualaf.