GenBank
Pangkalan data urutan GenBank ialah akses terbuka, koleksi penjelasan semua urutan nukleotida yang tersedia secara awam dan terjemahan protein mereka. Pangkalan data ini dihasilkan dan diselenggarakan oleh Pusat Maklumat Bioteknologi Negara (NCBI; sebahagian daripada Institut Kesihatan Kebangsaan di Amerika Syarikat) sebagai sebahagian daripada Kerjasama Pangkalan Data Pangkalan Data Urutan Nukleotida Antarabangsa (INSDC).
| GenBank | |
|---|---|
| Kandungan | |
| Perihalan | Pangkalan data jujukan dan perpustakaan data  |
| Jenis data diperoleh | Perubatan dan gen |
| Perhubungan | |
| Kutipan utama | PubMed |
| Capaian | |
| Format data | |
| Tapak web | NCBI |
sunting · sunting di Wikidata | |
GenBank dan kolaboratornya menerima urutan yang dihasilkan di makmal di seluruh dunia daripada lebih 100,000 organisma berbeza. Pangkalan data ini dimulakan pada tahun 1982 oleh Makmal Negara Los Alamos dan W. GenBank telah menjadi pangkalan data penting untuk penyelidikan dalam bidang biologi dan telah berkembang pada tahun-tahun kebelakangan ini pada kadar eksponen dengan menggandakan kira-kira setiap 18 bulan.[1][2]
Dikeluarkan 194, dihasilkan pada Februari 2013, mengandungi lebih daripada 150 bilion nukleotida di lebih daripada 162 juta urutan.[3] GenBank dibina melalui penyerahan langsung dari makmal individu, serta dari pengambilan pukal dari pusat penjujukan berskala besar.
Rujukan
sunting- ^ Benson D; Karsch-Mizrachi, I.; Lipman, D. J.; Ostell, J.; Wheeler, D. L. (2008). "GenBank". Nucleic Acids Research. 36 (Database): D25–D30. doi:10.1093/nar/gkm929. PMC 2238942. PMID 18073190. Unknown parameter
|displayauthors=ignored (bantuan) - ^ Benson D; Karsch-Mizrachi, I.; Lipman, D. J.; Ostell, J.; Sayers, E. W. (2009). "GenBank". Nucleic Acids Research. 37 (Database): D26–D31. doi:10.1093/nar/gkn723. PMC 2686462. PMID 18940867. Unknown parameter
|displayauthors=ignored (bantuan) - ^ "GenBank release notes". NCBI.
Pautan luar
sunting- GenBank
- Example sequence record, for hemoglobin beta
- BankIt
- Sequin — a stand-alone software tool developed by the NCBI for submitting and updating entries to the GenBank sequence database.
- EMBOSS — free, open source software for molecular biology
- GenBank, RefSeq, TPA and UniProt: What's in a Name?