''Lihat juga [[Pembunuhan kaumetnik di Rwanda#Akibat|Akibat Pembunuhan Kaumetnik di Rwanda]]''
Bilangan orang Islam Rwanda meningkat selepas [[Pembunuhan Kaumetnik di Rwanda|Pembunuhan Kaumetnik pada tahun 1994]] kesan daripada kemasukan ke dalam agama Islam dalam jumlah yang besar. Salah satu sebab yang mungkin ialah ramai orang Islam telah memberi perlindungan kepada pelarian-pelarian puak [[Kaum Hutu]] dan [[Kaum Tutsi]]. Sesetengah pihak menjelaskan bahawa mereka memeluk Islam kerana peranan yang dimainkan oleh pemimpin-pemimpin Katolik dan Protestan dalam pembunuhan kaum tersebut. Kumpulan-kumpulan [[hak asasi manusia]] telah mencatatkan beberapa insiden [[pendeta Kristian|pendeta-pendeta Kristian]] memberi kebenaran kepada puakKaum Tutsi untuk mendapatkan perlindungan di dalam gereja, kemudian menyerahkan mereka kepada skuad pembunuh Hutu. Contoh-contoh [[paderi]]-paderi Hutu yang menggalakkan jemaah mereka supaya membunuh puakKaum Tutsi juga telah dicatatkan.<ref name = "WashingtonPost">Emily Wax
. "[http://www.washingtonpost.com/wp-dyn/articles/A53018-2002Sep22.html Islam Attracting Many Survivors of Rwanda Genocide]," ''Washington Post''. Monday, September 23, 2002, Page A10 </ref>
Laporan-laporan perseorangan oleh beberapa orang puakKaum Tutsi yang memeluk Islam demi keselamatan diri kerana mereka takut akan pembunuhan tindak balas yang berterusan angkara pelampau puakKaum Hutu, dan tahu bahawa orang Islam dapat melindungi mereka daripada angkara sebegitu. Begitu juga ramai puak Hutu yang memeluk Islam untuk mencari "penyucian". Ramai puakkaum Hutu mahu melupakan masa silam mereka yang diselubungi keganasan dan tidak mahu "mencemari tangan mereka dengan darah". Terdapat sebilangan kecil contoh terasing yang menunjukkan puakKaum Hutu memeluk Islam dengan harapan bahawa mereka dapat bersembunyi di kalangan masyarakat orang Islam dan dengan itu terlepas daripada tangkapan.<ref name = "USIP"/><ref name = "BBC">{{cite news
