Kromosom 16 ialah salah satu daripada 23 pasang kromosom yang ditemui pada manusia. Kebiasanya manusia mempunyai dua salinan kromosom ini. Kromosom 16 merangkumi kira-kira 96 juta pasangan asas (bahan binaan DNA) dan mewakili hanya di kurang daripada 3% daripada jumlah DNA dalam sel.

Kromosom 16
Pasangan kromosom manusia 16 selepas proses penjaluran G.
Satu kromosom 16 dari ibu, dan satu lagi dari ayah.
Pasangan kromosom 16
pada kariogram lelaki manusia.
Ciri-ciri
Panjang (bp)96,330,374 bp
(CHM13)
Bilangan gen795 (CCDS)[1]
JenisAutosom
Kedudukan sentromerMetasentrik[2]
(36.8 Mbp[3])
Senarai gen lengkap
CCDSSenarai gen
HGNCSenarai gen
UniProtSenarai gen
NCBIGene list
Pemidang peta luaran
EnsemblKromosom 16
EntrezKromosom 16
NCBIKromosom 16
UCSCKromosom 16
Jujukan DNA penuh
RefSeqNC_000016 (FASTA)
GenBankCM000678 (FASTA)

Bilangan gen

sunting

Berikut adalah beberapa anggaran kiraan gen kromosom manusia 16. Oleh kerana penyelidik menggunakan pendekatan yang berbeza untuk anotasi genom bagi menganggar bilangan gen pada setiap kromosom berbeza-beza (untuk butiran teknikal, lihat penganggaran gen). Di antara pelbagai projek, projek jujukan pengekodan konsensus kolaboratif (CCDS) mengambil strategi yang sangat konservatif. Jadi ramalan nombor gen CCDS mewakili had yang lebih rendah pada jumlah bilangan gen pengekodan protein manusia. [4]

Dianggarkan oleh Gen pengekodan protein Gen RNA tanpa pengekodan Pseudogen Sumber Tarikh keluaran
CCDS 795 [1] 08-09-2016
HGNC 802 251 365 [5] 2017-05-12
Ensembl 865 1,046 462 [6] 29-03-2017
UniProt 838 [7] 28-02-2018
NCBI 912 652 502 [8] [9] [10] 19-05-2017

Penyakit dan gangguan

sunting

Ciri-ciri yang berkaitan

sunting
  • Rambut merah

Jalur sitogenetik

sunting
Ideogram-ideogram penjaluran-G kromosom manusia 16
Ideogram penjaluran-G kromosom manusia 16 pada resolusi 850 bes per set haploid (bphs). Jarak jalur dalam rajah ini adalah berkadar terus terhadap jarak pasangan bes. Ideogram seperti ini digunakan secara umum di pelayar-pelayar genom (contohnya seperti Ensembl, Pelayar Genom UCSC).
Corak-corak penjaluran-G kromosom manusia 16 pada tiga resolusi yang berbeza (400,[13] 550[14] dan 850[3]). Jarak jalur dalam rajah ini berdasarkan ideogram dari ISCN (2013).[15] Ideogram berjenis ini mewakili jarak jalur relatif yang diperhati bawah mikroskop pada masa-masa yang berbeza sewaktu proses mitosis.[16]
Penjaluran-G kromosom manusia 16 pada resolusi 850 bphs
Kromosom Lengan Jalur Pemula ISCN[17] Hentian ISCN[17] Pemula pasangan bes Hentian pasangan bes Pewarnaan Ketumpatan
16 p 13.3 0 352 1 7800000 gneg
16 p 13.2 352 596 7800001 10400000 gpos 50
16 p 13.13 596 813 10400001 12500000 gneg
16 p 13.12 813 948 12500001 14700000 gpos 50
16 p 13.11 948 1070 14700001 16700000 gneg
16 p 12.3 1070 1246 16700001 21200000 gpos 50
16 p 12.2 1246 1409 21200001 24200000 gneg
16 p 12.1 1409 1558 24200001 28500000 gpos 50
16 p 11.2 1558 1856 28500001 35300000 gneg
16 p 11.1 1856 2045 35300001 36800000 acen
16 q 11.1 2045 2194 36800001 38400000 acen
16 q 11.2 2194 2709 38400001 47000000 gvar
16 q 12.1 2709 2953 47000001 52600000 gneg
16 q 12.2 2953 3142 52600001 56000000 gpos 50
16 q 13 3142 3346 56000001 57300000 gneg
16 q 21 3346 3657 57300001 66600000 gpos 100
16 q 22.1 3657 4023 66600001 70800000 gneg
16 q 22.2 4023 4118 70800001 72800000 gpos 50
16 q 22.3 4118 4294 72800001 74100000 gneg
16 q 23.1 4294 4551 74100001 79200000 gpos 75
16 q 23.2 4551 4659 79200001 81600000 gneg
16 q 23.3 4659 4768 81600001 84100000 gpos 50
16 q 24.1 4768 4930 84100001 87000000 gneg
16 q 24.2 4930 5025 87000001 88700000 gpos 25
16 q 24.3 5025 5120 88700001 90338345 gneg


Rujukan

sunting
  1. ^ a b "Search results - 16[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("has ccds"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2016-09-08. Dicapai pada 2017-05-28.
  2. ^ Tom Strachan; Andrew Read (2 April 2010). Human Molecular Genetics. Garland Science. m/s. 45. ISBN 978-1-136-84407-2.
  3. ^ a b Genome Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (850 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2014-06-03. Retrieved 2017-04-26.
  4. ^ Pertea M, Salzberg SL (2010). "Between a chicken and a grape: estimating the number of human genes". Genome Biol. 11 (5): 206. doi:10.1186/gb-2010-11-5-206. PMC 2898077. PMID 20441615.
  5. ^ "Statistics & Downloads for chromosome 16". HUGO Gene Nomenclature Committee. 2017-05-12. Dicapai pada 2017-05-19.
  6. ^ "Chromosome 16: Chromosome summary - Homo sapiens". Ensembl Release 88. 2017-03-29. Dicapai pada 2017-05-19.
  7. ^ "Human chromosome 16: entries, gene names and cross-references to MIM". UniProt. 2018-02-28. Dicapai pada 2018-03-16.
  8. ^ "Search results - 16[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Dicapai pada 2017-05-20.
  9. ^ "Search results - 16[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ( ("genetype miscrna"[Properties] OR "genetype ncrna"[Properties] OR "genetype rrna"[Properties] OR "genetype trna"[Properties] OR "genetype scrna"[Properties] OR "genetype snrna"[Properties] OR "genetype snorna"[Properties]) NOT "genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Dicapai pada 2017-05-20.
  10. ^ "Search results - 16[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype pseudo"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Dicapai pada 2017-05-20.
  11. ^ Maillard, A M (25 November 2014). "The 16p11.2 locus modulates brain structures common to autism, schizophrenia and obesity". Molecular Psychiatry. 20 (1): 140–147. doi:10.1038/mp.2014.145. PMC 4320286. PMID 25421402.
  12. ^ Richter, M (21 February 2018). "Altered TAOK2 activity causes autism-related neurodevelopmental and cognitive abnormalities through RhoA signaling". Molecular Psychiatry. 24 (9): 1329–1350. doi:10.1038/s41380-018-0025-5. PMC 6756231. PMID 29467497.
  13. ^ Genome Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (400 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2014-03-04. Retrieved 2017-04-26.
  14. ^ Genome Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (550 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2015-08-11. Retrieved 2017-04-26.
  15. ^ International Standing Committee on Human Cytogenetic Nomenclature (2013). ISCN 2013: An International System for Human Cytogenetic Nomenclature (2013). Karger Medical and Scientific Publishers. ISBN 978-3-318-02253-7.
  16. ^ Sethakulvichai, W.; Manitpornsut, S.; Wiboonrat, M.; Lilakiatsakun, W.; Assawamakin, A.; Tongsima, S. (2012). Estimation of band level resolutions of human chromosome images. In Computer Science and Software Engineering (JCSSE), 2012 International Joint Conference on. m/s. 276–282. doi:10.1109/JCSSE.2012.6261965. ISBN 978-1-4673-1921-8. S2CID 16666470.
  17. ^ a b Nilai ISCN adalah berdasarkan panjang jalur/ideograms daripada buku ISCN, An International System for Human Cytogenetic Nomenclature (2013). Nilai arbitrari.

Pautan luar

sunting
  • National Institutes of Health. "Chromosome 16". Genetics Home Reference. Diarkibkan daripada yang asal pada August 3, 2004. Dicapai pada 2017-05-06.
  • "Chromosome 16". Human Genome Project Information Archive 1990–2003. Dicapai pada 2017-05-06.