Asid 3-fosfogliserik

Asid 3-fosfogliserik (3PG, 3-PGA atau PGA) ialah asid konjugat bagi 3-fosfogliserat atau gliserat 3-fosfat (GP atau G3P)[1] yang menjadi molekul perantara metabolisme utama biokimia dalam kedua-dua glikolisis dan kitaran Calvin. Anionnya sering disebut sebagai PGA apabila merujuk kepada kitaran Calvin. Dalam kitaran Calvin, 3-fosfogliserat lazimnya merupakan hasil pemotongan spontan perantaraan 6-karbon yang tidak stabil yang terbentuk apabila penetapan CO2. Oleh itu, dua 3-fosfogliserat molekul setara dihasilkan bagi setiap molekul CO2 yang ditetapkan.[2][3][4] Dalam glikolisis, 3-fosfogliserat menjadi molekul perantara berikutan penyahfosforilan (penurunan) 1,3-bisfosfogliserat.[4] :14

Asid 3-fosfogliserik
Struktur rangka asid 3-fosfogliserik
Nama
Nama IUPAC pilihan
Asid (2R)-2-hidroksi-3-(fosfonooksi)propanoik
Pengecam
Imej model 3D Jmol
3DMet
ChEBI
ChEMBL
ChemSpider
DrugBank
KEGG
  • InChI=1S/C3H7O7P/c4-2(3(5)6)1-10-11(7,8)9/h2,4H,1H2,(H,5,6)(H2,7,8,9)/t2-/m1/s1 ☑Y
    Key: OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N ☑Y
  • C([C@H](C(=O)O)O)OP(=O)(O)O
Sifat
C3H7O7P
Jisim molar 186.06 g/mol
Kecuali jika dinyatakan sebaliknya, data diberikan untuk bahan-bahan dalam keadaan piawainya (pada 25 °C [77 °F], 100 kPa).
 ☑Y pengesahan (apa yang perlu☑Y/N?)
Rujukan kotak info

Glikolisis

sunting

Dalam laluan glikolisis, 1,3-bifosfogliserat dinyahfosforilasi untuk membentuk asid 3-fosfogliserik dalam tindak balas bergandingan untuk menghasilkan dua ATP melalui pemfosforilan peringkat substrat.[5] Kumpulan fosfat tunggal yang tertinggal di molekul 3-PGA kemudian bergerak dari karbon hujung ke karbon pusat lalu menghasilkan 2-fosfogliserat.[5][a] Penempatan semula kumpulan fosfat ini dimangkinkan oleh fosfogliserat mutase, enzim yang turut memangkinkan tindak balas berlawanan.[6]

Kitaran Calvin

sunting

Dalam tindak balas bebas cahaya (juga dikenali sebagai kitaran Calvin), dua molekul 3-fosfogliserat disintesis. RuBP, gula 5 atom karbon mengalami penetapan karbon yang dimangkinkan enzim RuBisCO untuk menjadi molekul perantara 6 atom karbon yang tidak stabil. Perantara ini kemudiannya pecah kepada dua molekul 3-PGA 3 atom karbon berasingan.[7] Salah satu molekul 3-PGA yang terhasil diteruskan melalui kitaran Calvin untuk dijana semula menjadi RuBP manakala satu lagi diturunkan untuk membentuk satu molekul gliseraldehid 3-fosfat (G3P) dalam dua langkah: pemfosforilan 3-PGA menjadi asid 1,3-bisfosfogliserik melalui enzim fosfogliserat kinase (tindak balas terbalik dengan yang ada dalam glikolisis) dan pemangkinan seterusnya oleh gliseraldehid 3-fosfat dehidrogenase kepada G3P.[8][9][10] G3P akhirnya bertindak balas untuk membentuk gula seperti glukosa atau fruktosa atau kanji yang lebih kompleks.[4] :156[8][9]

Sintesis asid amino

sunting

Gliserat 3-fosfat (terbentuk daripada 3-fosfogliserat) juga merupakan pelopor asid amino serina, dan kemudian boleh menghasilkan sisteina dan glisina melalui kitaran homosisteina.[11][12][13]

Pengukuran

sunting

3-fosfogliserat boleh diasingkan dan diukur menggunakan kromatografi kertas[14] serta kromatografi lajur, antara alain.[15] Ia boleh dikenal pasti menggunakan gas kromatografi serta spektrometri jisim kromatografi cecair, dan telah dioptimumkan bagi tujuan penilaian menggunakan teknik MS tandem.[1][16][17]

  1. ^ Ambil perhatian bahawa 3- dan 2-fosfogliserat merupakan pasangan isomer.

Rujukan

sunting
  1. ^ a b "3-Phosphoglyceric acid (HMDB0000807)". Human Metabolome Database. The Metabolomics Innovation Centre. Dicapai pada 23 May 2021.
  2. ^ Berg, J.M.; Tymoczko, J.L.; Stryer, L. (2002). Biochemistry (ed. 5th). New York: W.H. Freeman and Company. ISBN 0-7167-3051-0.
  3. ^ Nelson, D.L.; Cox, M.M. (2000). Lehninger, Principles of Biochemistry (ed. 3rd). New York: Worth Publishing. ISBN 1-57259-153-6.
  4. ^ a b c Leegood, R.C.; Sharkey, T.D.; von Caemmerer, S., penyunting (2000). Photosynthesis: Physiology and Metabolism. Advances in Photosynthesis. 9. Kluwer Academic Publishers. doi:10.1007/0-306-48137-5. ISBN 978-0-7923-6143-5.
  5. ^ a b Rye, Connie; Wise, Robert; Jurukovski, Vladimir; DeSaix, Jean; Choi, Jung; Avissar, Yael (2016). "Glycolysis". Biology. OpenStax College.
  6. ^ Rose, Z.B.; Dube, S. (1976). "Rates of phosphorylation and dephosphorylation of phosphoglycerate mutase and bisphosphoglycerate synthase". Journal of Biological Chemistry. 251 (16): 4817–4822. doi:10.1016/S0021-9258(17)33188-5. PMID 8447.
  7. ^ Andersson, I. (2008). "Catalysis and regulation in Rubisco". Journal of Experimental Botany. 59 (7): 1555–1568. doi:10.1093/jxb/ern091. PMID 18417482.
  8. ^ a b Moran, L. (2007). "The Calvin Cycle: Regeneration". Sandwalk. Dicapai pada 11 May 2021.
  9. ^ a b Pettersson, G.; Ryde-Pettersson, Ulf (1988). "A mathematical model of the Calvin photosynthesis cycle". European Journal of Biochemistry. 175 (3): 661–672. doi:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14242.x. PMID 3137030.
  10. ^ Fridlyand, L.E.; Scheibe, R. (1999). "Regulation of the Calvin cycle for CO2 fixation as an example for general control mechanisms in metabolic cycles". Biosystems. 51 (2): 79–93. doi:10.1016/S0303-2647(99)00017-9. PMID 10482420.
  11. ^ Igamberdiev, A.U.; Kleczkowski, L.A. (2018). "The Glycerate and Phosphorylated Pathways of Serine Synthesis in Plants: The Branches of Plant Glycolysis Linking Carbon and Nitrogen Metabolism". Frontiers in Plant Science. 9 (318): 318. doi:10.3389/fpls.2018.00318. PMC 5861185. PMID 29593770.
  12. ^ Ichihara, A.; Greenberg, D.M. (1955). "Pathway of Serine Formation from Carbohydrate in Rat Liver". PNAS. 41: 605–609. Bibcode:1955PNAS...41..605I. doi:10.1073/pnas.41.9.605. JSTOR 89140. PMC 528146. PMID 16589713.
  13. ^ Hanford, J.; Davies, D.D. (1958). "Formation of Phosphoserine from 3-Phosphoglycerate in Higher Plants". Nature. 182 (4634): 532–533. Bibcode:1958Natur.182..532H. doi:10.1038/182532a0.
  14. ^ Cowgill, R.W.; Pizer, L.I. (1956). "Purification and Some Properties of Phosphorylglyceric Acid Mutase from Rabbit Skeletal Muscle". Journal of Biological Chemistry. 223 (2): 885–895. doi:10.1016/S0021-9258(18)65087-2. PMID 13385236.
  15. ^ Hofer, H.W. (1974). "Separation of glycolytic metabolites by column chromatography". Analytical Biochemistry. 61 (1): 54–61. doi:10.1016/0003-2697(74)90332-7. PMID 4278264.
  16. ^ Shibayama, J.; Yuzyuk, T.N.; Cox, J. (2015). "Metabolic Remodeling in Moderate Synchronous versus Dyssynchronous Pacing-Induced Heart Failure: Integrated Metabolomics and Proteomics Study". PLOS ONE. 10 (3): e0118974. Bibcode:2015PLoSO..1018974S. doi:10.1371/journal.pone.0118974. PMC 4366225. PMID 25790351. Unknown parameter |displayauthors= ignored (bantuan)
  17. ^ Xu, J.; Zhai, Y.; Feng, L. (2019). "An optimized analytical method for cellular targeted quantification of primary metabolites in tricarboxylic acid cycle and glycolysis using gas chromatography-tandem mass spectrometry and its application in three kinds of hepatic cell lines". Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. 171: 171–179. doi:10.1016/j.jpba.2019.04.022. PMID 31005043.