Pengguna:PeaceSeekers/Wikipedia Pendidikan/Biokimia/Bahagian II

Metabolisme I

• Metabolisme
  • Karbohidrat
  • Lipid

Asas metabolisme

• Metabolisme
  • Kegunaan oksigen: Aerob / Anaerob (fakultatif / obligat)
  • Gaya laluan: Anabolisme / Katabolisme
  • Sumber tenaga
    • Adenosina trifosfat
    • Nikotinamida adenina dinukleotida
    • Vitamin (koenzim)
• Bioenergetik
  • Tenaga bebas
• Kawal atur metabolisme
  • Intrasel
  • Luar sel
  • Pengutus kedua
    • GPCR + Adenilil siklase

Metabolisme karbohidrat

• Metabolisme karbohidrat
  • Pengangkutan glukosa
    • Pengangkut glukosa

Glikolisis

• Glikolisis

Kitaran asid sitrik

Termasuk penukaran piruvat

• Piruvat
  • Kompleks piruvat dehidrogenase
    • Piruvat dehidrogenase
• Kitaran Krebs
• Kitaran glioksilat
• Pemfosforilan oksidaan
  • ATP sintase

Pengangkutan membran respirasi

• Pengulang-alik gliserol fosfat
• Pengulang-alik malat-aspartat

Glukoneogenesis

• Glukoneogenesis

Glikogenolisis dan glikogenesis

• Glikogenolisis
• Glikogenesis

Pentosa fosfat

• Laluan pentosa fosfat

Metabolisme lipid

• Metabolisme lipid

Asid lemak

• Metabolisme asid lemak
  • Pengoksidaan beta
  • Badan keton
  • Sintesis asid lemak

Trigliserida

• Metabolisme trigliserida

Eikosanoid

• Metabolisme eikosanoid
  • Perencat: Ubat antiradang bukan steroid

Kolesterol

• Metabolisme kolesterol
  • Kawal atur: SREBP / Statin

Metabolisme II

• Metabolisme
  • Protein
    • Nukleotida

Metabolisme asid amino

Asas metabolisme asid amino

• Metabolisme asid amino
  • Transaminasi
  • Deaminasi
  • Pusing ganti protein

Pemerolehan asid amino

• Pencernaan protein
  • Pepsin
  • Protease
    • Kawal atur: Kolesistokinin / Sekretin
  • Kekurangan rembesan
    • Steatorea
  • Aminopeptidase

Perkumuhan nitrogen

• Transaminasi
  • alfa-Ketogluratat
  • Glutamat
  • Aminotransferase: alanina transaminase / aspartat transaminase
  • Piridoksal fosfat
• Deaminasi
  • Glutamat dehidrogenase
• Kitaran urea

• Kesudahan urea
  • Urease
    • Perencat: Neomisin

• Ammonia
  • Pengangkut ammonia: glutamat dehidrogenase / glutamina sintetase / karbamoil fosfat sinetase I
  • Hiperammonemia
    • Ubat: Fenilbutirat

Penguraian asid amino

• Asid amino
  • Asid amino glukogenik
  • Asid amino ketogenik
  • Asid amino rantai bercabang

• Klinikal
  • Asid folik
  • Penyakit penguraian
    • Fenilketouria
      • Hiperfenilalaninemia
        • Ubat: Tetrahidrobiopterin / L-DOPA + 5-Hidroksitriptofan
    • Alkaptonuria
    • Albinisme
    • Penyakit kencing sirap mapel
    • Homosistinuria

Porfirin dan hem

• Porfirin
  • Hem
• Porfirinogen

• Sintesis hem
• Penguraian hem
• Porfiria
  • Porfiria kutanea tarda

Metabolisme nukleotida

• Purina
  • Metabolisme purina
    • Sintesis de novo
    • Laluan penyelamatan asid nukleik
  • Penguraian ribonukleotida
    • Gout
      • Ubat: Alopurinol
• Pirimidina
  • Metabolisme pirimidina

Biomolekul

• Biomolekul

Protein dan asid amino

• Protein

• Asid amino
  • Tindak balas asid amino
    • Bes Schiff (dengan aldehid)
    • Ninhidrin -> hidrindantin
  • Asid amino terubah suai
    • Hidroksiprolina
    • Metillisina / metilhistidina
    • Asid karboglutaminik
    • Desmosina / Isodesmosina

• Peptida
  • Tindak balas peptida
    • Ujian Biuret
  • Peptida aktif
    • Oksitosin
    • Vasopresin
    • Glutation
    • Angiotensin II
  • Peptida sintetik
    • Sintesis tahap pepejal
      • Kumpulan pelindung
        • tert-Butiloksikarbonil

• Enzim
  • Tapak aktif
  • "Pembantu" enzim
    • Koenzim
    • Kofaktor
    • Kumpulan prostetik
  • Kinetik enzim
    • Unit enzim
    • Aktiviti khusus
    • Nilai pusing ganti
    • Persamaan Michaelis-Menten
      • Plot Lineweaver-Burk
  • Perencatan enzim
    • Jenis perencat
      • Berpersaingan
      • Tak berpersaingan (un-competitve)
      • Tanpa persaingan (non-competitive)
  • Kawalan aktiviti enzim
    • Zimogen
    • Pengawalaturan alosterik
      • Pemodulat alosterik

Lipid

• Lipid
  • Asid lemak
    • Tepu dan tak tepu (asid lemak politak tepu [PUFA])
  • Lipid ringkas
    • Trigliserida
      • Pemperoksidaan lipid
  • Lipid kompleks
    • Fosfolipid
      • Sefalin / Lesitin (Fosfatidilkolina) / Fosfatidilserina / Fosfatidilinositol
    • Sfingolipid
      • Seramida
      • Glikolipid
        • Serebrosida
          • Galakto- / Gluko-
        • Sulfatida
        • Gangliosida
      • Sfingomielin
  • Steroid
    • Asal: Lanosterol / Sikloartenol
    • Kolesterol
      • Hormon steroid
        • Hormon seks: Testosteron / Estrogen / Progesteron
        • Mineralokortikoid: Aldosteron
        • Glukokortikoid: Kortisol / Kortison / Prednisolon
  • Eikosanoid
    • Jenis: Prostaglandin / Tromboksana / Leukotriena / Lipoksin
    • Metabolisme eikosanoid
  • Terpena
    • Isoprena
      • Vitamin A (retinol <- beta-Karotena)
      • Vitamin E (Tokoferol / Tokotrienol)
  • Lipoprotein
    • Jenis: Kilomikron / VLDL / IDL / LDL / HDL
    • Apoprotein

Karbohidrat

• Karbohidrat
  • Tindak balas karbohidrat
  • Disakarida
    • Maltosa / Laktosa / Sukrosa
      • Galaktosemia
  • Polisakarida
    • Kanji / Glikogen
    • Beta-glukan
    • Selulosa
    • Kitin
    • Polisakarida bercas
      • Glikosaminoglikan
        • Asid hialuronik / Heparin / Kondroitin sulfat / Keratan sulfat / dermatan sulfat
      • Peptidoglikan
        • Asid N-asetilmuramik
      • Glikoprotein
        • Musin
        • Protein antibeku
        • Sistem kumpulan darah ABO

Asid nukleik

• Asid nukleik
• Nukleobes
  • Purina: Adenina / Guanina
  • Pirimidina: Sitosina / Urasil / Timina
• DNA
  • Konformasi DNA: A-DNA / B-DNA / Z-DNA
• RNA
  • Jenis fungsi: mRNA / tRNA / rRNA

Biokimia protein

• Protein

Struktur primer

• Struktur primer protein
  • Ikatan disulfida
  • Penentuan struktur
    • SDS-PAGE
    • Analisis terminal N
      • Prob molekul: Reagen Sanger / Dansil klorida / Kalium sianat / Fenil isotiosianat
    • Analisis terminal C
      • Peptidase: Endopeptidase / Aminopeptidase / Karboksipeptidase / Eksopeptidase
    • Penentuan asid amino
      • Protease: Termolisin / Elastase pankrease / Subtilisin / Protease Staphylococcus
    • Ikatan disulfida: Merkaptoetanol / Ditriotreitol / Asid performik

Struktur sekunder

• Struktur sekunder protein
  • Heliks alfa
    • Heliks 310
    • Heliks pi
  • Helaian beta
  • Penentuan struktur sekunder
• Struktur supersekunder

Struktur tertier

• Struktur tertier protein
  • Lipatan protein
    • Keadaan jati
    • Tenaga bebas
    • Paradoks Levinthal
  • Pembubaran protein
    • Penyahaslian
    • Penguraian protein
      • Proteasom dan ubikuitin
      • Lisosom: autofagi

Enzim

• Enzim

Latar belakang

• Hukum termodinamik pertama
• Tenaga pengaktifan
• Pemangkinan

Ciri-ciri enzim

• Pengkhususan kimia
• Perencat enzim
  • Analog tahap peralihan

Mekanisme enzim

• Lisozim
• Kimotripsin
  • Triad pemangkinan

Perencatan enzim

• Perencatan enzim
  • Jenis perencat
    • Berpersaingan
    • Tak berpersaingan (un-competitve)
    • Tanpa persaingan (non-competitive)

Kawal atur enzim

• Kawal atur enzim
  • Kawal atur genetik (cth.: operon lac)
  • Kawal atur terus
    • Zimogen
    • Pemfosforilan
    • Pengadenilan
    • Kawal atur alosterik

Biologi molekul

• Biologi molekul

Replikasi DNA

• Replikasi DNA
• Replikasi prokariot
  • Asalan replikasi
  • Cabang replikasi
  • Kompleks prareplikasi
• Replikasi eukariot
  • Fasa S
  • Kompleks prareplikasi
  • Kompleks pengenalpastian asalan

Transkripsi DNA

• Transkripsi DNA
  • RNA polimerase
  • Promoter
• Transkripsi prokariot
  • Faktor ro
• Transkripsi eukariot
  • Pengubahsuaian pascatranskripsi
    • Pempoliadenilan
    • Penyambungan RNA
      • Spliseosom

Terjemahan RNA

• Terjemahan RNA
  • tRNA
  • Ribosom

Ekspresi gen

• Ekspresi gen
• Ekspresi prokariot
  • Operon
    • Contoh: Operon lac / SPO1 / merT / operon trp
• Ekspresi eukariot
  • Penyambungan selang-seli
  • Pencetus
    • Protein kejutan haba
  • Pengubahsuaian pascaterjemahan
    • siRNA / miRNA

Mutasi

• Mutasi
• Kerosakan DNA semula jadi
• Punca mutasi
  • Pendeaminaan / Pendepurinaan
  • Pengalkilan (cth.: nitrosamina)
  • Pengoksidaan (cth.: 8-oksoguanina)
  • Radiasi (cth.: dimer pirimidina)
  • Analog bes (cth.: 5-bromourasil)
  • Penyisipan (cth.: etidium bromida)
• Pembaikian mutasi
  • Pembaikian DNA
    • Pembaikian untaian tunggal
      • Pembaikian ketakpadanan DNA
      • Pembaikian terus
        • Fotoliase
        • Metiltransferase
        • Glikosilase
      • Pembaikian pemotongan bes
      • Pembaikian pemotongan nukleotida
      • Translesi
    • Pembaikian kedua-dua untaian
      • NHEJ
      • Rekombinasi homolog
      • Rekombinasi khusus tapak
      • Pemindahan gen mengufuk
        • Transposon

Pewarisan luar kromosom

• Pewarisan bukan Mendel
  • Pewarisan luar nukleus
    • DNA mitokondrion